为了寻找能够代替在上一次战斗中失去了的“ 光之剑”的武器，莉娜与高里再一次踏上了旅途。在途中遇见了为了作掉海贼而造访露维纳刚鲁多王国的阿美利亚与吉路刚帝士，虽然为老朋友间的再会而感到喜悦，但是、在他们面前出现了的露维纳刚鲁多王国的监察者——特务搜查官，一个被称为瓦依扎的男人。他的想法与行动让莉娜感到愕然……

在遥远的未来，彼时，地球已经被人类所制造的污染破坏殆尽，更有污染产生了邪恶怪兽横行占领了人类的生存空间。无奈之下，人类只能移居到了拥有独立意识的“自律型移动都市”之中，而这些都市之间，则为了争夺少之又少的资源而展开了激烈的争斗。　　在学院都市洁儿尼中发生了一场骚乱，刚刚入学就读于普通教育系的新生雷冯（冈本信彦 配音）在混乱之中展现了自己出色的应变和战斗的能力，因此被学生会长发掘，转入了武技系，更获得了加入都市护卫第十七小队的资格。外冷内热沉默寡言的菲丽、恪尽职守坚韧强悍的妮娜、个性轻浮但十分可靠的夏尼