拥有用肉眼看见“菌”能力的少年泽木惣右卫门直保和青梅竹马结城萤进入农业大学所发生一连串的趣事，透过直保和其他人物的互动可以了解许多跟菌相关的知识，也因为直保的特殊能力而招惹许多事情……

故事发生在氛围轻松制度宽松的七森中学，为了打发无聊的课后时光，个性天真单纯的少女赤座灯里（三上枝织配音）伙同童年好友岁纳京子（大坪由佳配音）与船见结衣（津田美波配音），利用荒废已久的茶道社组成了一个名