故事发生在星之海学园中，表面看来，乙坂有宇（内山昂辉 配音）不过是一个平凡的少年，然而，实际上，他拥有着能够夺取他人身体的超能力。这么多年来，乙坂依靠着自己的超能力平安度日，当他以为平静的日子将会

距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。