舞台是象征理性的「青之世界」，然而正在遭受由本能支配的「红之世界」的生命体NightflyO’Note的袭击与侵略。17岁的主人公麻黄Akira就职为青之世界研究员，随后因为能力出众而被提拔为最前

造成過去世界崩壞的「人類史上最大最惡的絕望事件」―――被稱之為超高校級的絕望的他們，在世界各地同時發動了多起恐怖攻擊…為了與他們進行對抗，而有人設立了「未來機關」。過去的英雄・苗木誠被視為反叛者、被叫到受召集而來的未來機關幹部們面前。此時，突然間響起了黑白熊的聲音，「唔噗噗噗。這次我要讓未來機關的各位…展開互相殘殺！」

召集了各个分野上的超一流的高中生，为培育他们成长而设立的政府公认特权学园「私立希望之峰学园」。在这个学园，存在着云集了超高校级的才能的"本科"，与只要支付了高额学费就谁都能够入学的

　　故事发生在一个架空的世界之中，这里被分为五个部分，人类所居住的地球、诸神的红色世界、理性与科学统治的白色世界、充满了魔法的黑色世界以及崇尚武力和战争的绿色世界。长久以来，五个世界相互制约抗衡，形成