年幼的爱力克兄弟十分思念去世的母亲，不惜触犯炼金术中最大的禁忌，进行了人体炼成。可是炼成失败了，哥哥爱德华失去了左腿与右臂，弟弟阿尔冯斯失去了肉体，只能把灵魂附身在一副铠甲上。为了偿还他们自己的罪

故事描述在称为布雷斯提尔的世界，名为“吉尔多”的巨大组织独霸了航空技术，企图利用手中强大的科技力量控制世界。这个世界的两大国家安纳托雷和度西斯处于交战状态，为了争夺霸权，两国都委托吉尔多设计空中战舰，

叙述了遵循母命转学到南阳学院的女高中生主角孙策伯符，踏入制霸全国的争端当中，从南阳学院中的权势之争，到校外的斗士大会，孙策逐渐领悟到君主的任务。 （故事延展到与董卓仲颖决战间断，本作剧情现已与漫画原作有很大的区别）