時值江戶時期。日本橋的知名大商號「長崎屋」的少主 一太郎，自出生起便身體虛弱、難以外出。而陪伴在一太郎身邊的，則是白澤、犬神等妖怪，時時守護著他。某天夜裡，一太郎避開眾人的目光外出，卻目擊到一樁殺人事件…借助妖怪們的力量，一太郎開始了尋找兇手的調查！

位處大陸中央的某個大國，有位姑娘置身於皇帝宮闕之中。姑娘名喚貓貓，原在煙花巷擔任藥師，眼下則在後宮做下女。這個絕對稱不上美女的姑娘很懂分寸，只是靜待期滿離宮。她有自信，皇帝絕對不會「寵幸」她。其間，貓貓得知皇子皆年幼早夭的事，並聽聞連尚在人世的皇子皇女也身染重病，她開始調查他們的病因──

国立署的新手刑警宝生丽子是世界知名的“宝生集团”的千金。在“风祭汽车”的继承人风祭警部的指导下，她正在奋力解决各种案件。回到豪宅后，丽子从朴素的裤装换上礼服，享受晚宴。然而每当她遇到棘手的案件时，寻求意见的对象都是“管家兼司机”的影山。“小姐的眼睛是筛子吗？”——虽然影山用接近暴言的毒舌指出丽子的推理能力不足，但他依然巧妙地揭开了案件的谜团。

「我一直想知道，戀愛究竟是怎樣的感覺。」升上高二，解除了「互惠關係」的小鳩和小佐內，如今分道揚鑣。小佐內開始和校刊社一年級的瓜野交往。瓜野為了在學校留下功績，向小佐內展現自己的才華，想盡辦法報導市內發生的縱火案。另一邊，小鳩開始和同班同學仲丸交往。本該平靜度日的他，卻在某天經過河岸時撞見了縱火現場……決意回歸小市民的小鳩和小佐內，到底會有什麼事情等待著兩人呢？

天醫會綜合醫院統括診斷部負責診斷被各個科別判定為「難以醫治」的患者。部長．天久鷹央是個思路清晰、博學多聞的天才，也是個怪人。堅持自己看到了河童的少年、看到鬼火而害怕不已的護理師、發現自己突然懷孕而萬分激動的女高中生－－各種疑難雜症在她的推理之下皆無所遁形，甚至還連帶解決了犯罪事件！