《创圣大天使LOGOS》讲述由于SNS的普及，现代的无意义文字正在增加。在文字的世界LOGOS WORLD，发生了影响到现实世界的异常事态。灰吹阳等创声部的成员为了解开文字中隐含的意义，直面世界的

超大型武器．OBJECT，它的出現立刻改寫戰爭的常識。戰車、戰鬥機這些過去戰場上的主角，全都成為「舊世代武器」；至於普通的機槍、砲彈、飛彈等等，簡直和玩具槍沒什麼兩樣。被派遣到戰場的留學生庫溫瑟，在整備基地與OBJECT操縱者米琳達相遇，一同以士兵的身份對抗超大型兵器OBJECT。

故事背景在剧场版《苍穹之法芙娜HEAVENANDEARTH》的2年后，由于与来主操的邂逅，龙宫岛获得了与Mir对话的手段，这也给岛带来了可能性。阿尔维斯的孩子们一边进行战斗的准备，一边摸索着理解敌人的

憑藉在假象訓練中培養出的優異能力，升格為正規操縱士的長道，在一次與奇居子的激戰中失去了戰友星白閑。在面對以模仿衛人星白機的最強敵人．紅天蛾為首的奇居子猛攻下，雖然一度陷入苦戰，最終還是渡過小行星撞擊危機的希德尼婭，為了驅逐奇居子的巢穴，決定前往雷姆恆星系……

　　沃斯帝国公主艾瑟依拉姆·薇瑟·艾莉欧斯亚（アセイラム・ヴァース・アリューシア）以亲善大使的身份访问地球，在其身后目送其离开的则是于地球出生而在火星上长大的少年斯雷因·特洛耶特（スレイン・トロイヤー

在“神化”时代的东京，充斥着无数的英雄——“超人”。　　他们的诞生理由各有不同。　　既有被邪恶组织改造的人，也有来自宇宙的人。　　既有来自魔法世界的人，也有来自古代、身为妖怪而生的人。　　既有被科学家