阿米蒂埃和琦莉耶还有她们的家人从小就过着幸福的生活，但随着厄立特里亚慢慢的毁灭，其父患上不治之病而去世。父亲的去世使得琦莉耶受很大的打击，然后琦莉耶开始讨厌其姐姐并对付她。与此同时，奈叶、菲特还有疾风

半年前的一连串遭遇，彻底改变了三年级小学生高町奈叶（田村由香里 配音）的人生，她以魔法少女的身份邂逅了可爱的小伙伴尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰），并通过连番激战与深锁着无数秘密和烦恼的菲特·泰斯特罗莎