日本是怪獸出現率在世界上名列前茅的「怪獸強國」。日比野卡夫卡，32歲，任職怪獸清潔公司，幹著怪物屍體清潔工的工作。他在小時候跟兒時好友亞白米娜約定「一起消滅所有怪獸」。到現在，米娜已經成為日本防衞隊第3部隊的隊長，反觀自己已經放棄加入防衞隊的夢想，過著平凡的生活...