在寶島上的激烈戰動結束，千空一行人平安無事地回到科學王國。使用得到手的實話裝置，成功讓進入冷凍睡眠狀態的司復活。司也成為科學王國的同伴了！接下來，千空一行人為了阻止位於「月球」根據地讓人類石化的幕後黑手・WHY人，而以前往月球為目標！在這個石之世界，從零開始打造太空船的大計畫開始了。話不多說，為了從全世界收集打造太空船的材料，千空一行人乘著珀耳修斯號奔向大海。製造復活液需要大量的玉米，因此第一個目的地，就是美洲大陸。勇氣、結束、科學力量，挑戰這一切的大航海計畫前方，另千空等人動搖的威脅正等著他們──！終於，千空一行人的冒險，將擴大致世界以及外太空！為了拯救人類的未來，千空與同伴們一同盡全力開拓科學之道！