在与奥尔费斯·秩序的战斗后，晋级为高中二年级的凯特，为了找回拼图师真方金失去的记忆而来到英国。凯特等人访问了他小时候与真方金相遇的教堂。在那里，一名少女出现，朝真方金奔去，喊道：“我想你了。”真方金呼唤少女的名字“雷兹尔”。他们是熟人吗？……但是！突然那个雷兹尔向凯特等人发起了拼图对战挑战！与此同时，√学园里，嘉蒙等人正被自称为谜者的男子设下拼图陷阱……。不仅凯特和伙伴们，连卢克和自由单元也被卷入了再次展开的拼命拼图战斗。雷兹尔和谜者的目的是什么？凯特能否揭开埋藏在真方金记忆中的“《法伊·布雷恩》和《神之拼图》的真相”？