八坂一（三瓶由布子 配音）是一位热爱科学的平凡少年，他坚信世界上的一切都可以用科学解释。然而，某一日，八坂一邂逅了名为岚山小夜子（白石凉子 配音）的神秘少女，她的出现以及随后而来的不思议事件颠覆了八坂一的全部世界观。　　两人的相遇令他们获得了穿越回过去的特殊能力，与此同时，女扮男装的上贺茂润（小见川千明 配音）、同样拥有穿越时空的能力的德国少女可雅（名冢佳织 配音）、一直追随着小夜子的墨镜男村田英雄（安元洋贵 配音）、痴情而又倔强的山崎加奈子（堀江由衣 配音）以及身世神秘的少女伏见弥生（野中蓝 配音）

利用暑假机会来乡下祖父家住的八坂一，在偶然进入一家咖啡店纳凉时，对那里的店员岚一见钟情。在某个契机下，岚碰到八坂一的瞬间，两人之间仿佛产生了雷电般的强烈冲击。岚惊呼“连通了！”，然后带着震惊的八坂一跑到外面。两人一起跑过后山，映入眼帘的却是一片看起来不像现代日本的景象……