培育只有女性能使用的兵器「Infinite Stratos（IS）」操縱者的學校「IS 學園」裡，聚集了世界各地而來的少女，以 IS 候補生身分，每天努力不懈…但明明是男生，卻能夠操縱 IS 的「織斑一夏」被強制進入「IS 學園」就讀。當然，他的周圍全都是女性，而女生們也對這位「世上唯一能使用 IS 的男性」感到興趣。一夏波瀾萬丈的學校生活就此展開！？