隨著AR技術的發展，一項技術被研發成功，其名為混合現實系統，簡稱MR系統。使用MR進行的校園虛擬戰鬥「Circlet Bout」作為一項運動在女高中生中流行開來。這項運動的人氣甚至衝破了學園，熱潮席捲了各地，明星選手甚至能擁有國民級的人氣。另一方面，聖同盟學園Circlet Bout部已經從過去的輝煌衰落到將要廢部，主人公佐佐木優佳為了參加這項運動，從和歌山的深山中來到了東京的聖同盟學園。優佳究竟能否成為聖同盟學園的救世主呢？

随着技术的进步，改造人和机器人在一般社会也开始广泛使用的未来。这是个在全世界频繁发生大规模自然灾害的同时，社会的贫富差距也在扩大的混乱时代。除了大脑以外全身机械化的“全身义体”少女·福音，造访了最高级的休闲岛屿“赛楠库尔岛”。但，持有强力武装的“巨大自律型挖掘机”布耶尔突然暴走，和平的岛面临崩坏的危机。福音协助在岛上遇到的神秘科学家乌萨尔·大利拉，以及美少女型智能机器人“库拉莉翁”，向布耶尔发起反抗。