故事從滅卻師的反撲開始，曾經被封印的滅卻師之王——優哈巴哈帶領一眾滅卻師組成「看不見的帝國」，攻佔虛圈，並且向屍魂界宣戰。他們蓄積已久的實力對上剛經過內亂的護廷十三隊，打得護廷十三隊傷亡慘重，巨大的陰影壟罩整個屍魂界。收到求救訊息的一護與夥伴們無懼地踏上征途，背負著所有人的期望，一護將與滅卻師們展開決戰…