“才贺”是日本大财团，以高科技产品闻名，才贺集团的各式各样机械技术之所以处于领导地位，是因为才贺家的男性由他们的祖先到现在都很喜欢机动木偶， 所以对于机械设计颇有心得。才贺集团主席才贺贞义和情妇生下一

有著治癒魔物之心能力的癒術士少年優，小時候父親送給他一個不可思議的瓶子作為禮物，優碰到瓶子後，裡面出現了一名液體狀的少女「梅露可」。梅露可沒有與優相遇之前的記憶，她想知道自己究竟是什麼人，於是兩人踏上了周遊列國的旅程。有著魔物恐懼症的見習癒術士優，和瓶中少女梅露可兩人身邊發生的幻想喜劇就此開幕。

自從與逃離魔法世界的茵蒂克絲相遇後，上条當麻便接二連三地被捲入各式各樣的事件中。在上条不斷試圖解決統治學園都市的「科學」側與「魔法」側之間的衝突時，一群因為與上条接觸而使得命運大大改變的「英雄」們，也將再次挺身與世界對峙。當科學與魔法三度交鋒之時，故事將發生巨大的改變！

在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。此作的世界观与TYP