造成過去世界崩壞的「人類史上最大最惡的絕望事件」―――被稱之為超高校級的絕望的他們，在世界各地同時發動了多起恐怖攻擊…為了與他們進行對抗，而有人設立了「未來機關」。過去的英雄・苗木誠被視為反叛者、被叫到受召集而來的未來機關幹部們面前。此時，突然間響起了黑白熊的聲音，「唔噗噗噗。這次我要讓未來機關的各位…展開互相殘殺！」

召集了各个分野上的超一流的高中生，为培育他们成长而设立的政府公认特权学园「私立希望之峰学园」。在这个学园，存在着云集了超高校级的才能的"本科"，与只要支付了高额学费就谁都能够入学的