八凪幸人是在本島育幼院長大的少年。某天，突然出現一位旁若無人的少年，名叫沙川盡義，自稱是幸人亡父的徒弟，並帶幸人回到故鄉——綾島。綾島由七座島嶼相連構成，火與水之龍的傳說根深蒂固，名為「御魂」的神奇存在理所當然地棲息於此，是極為奇妙的島嶼。幸人與曾是守護綾島和諧的仙人父親的三個徒弟互相交流，在綾島展開新的生活。但是盡義的另外兩位師兄——鞍馬春秋與伊吹朱之間有著深仇大恨，互不相讓。於和諧逐漸失衡的綾島，幸人即將面對的真相是……

今晚，一个画皮店的叔叔，讲述了一个奇怪而诡异的故事，出现在了所有人面前。 这一次，他讲述了各种都市传说，这些传说在“re”这个主题上是可怕的、新的、有点怀旧的。 人们将再次在恐惧中度过不眠之夜。

「巨獸」創造了大地，人類卻霸佔了大地，「巨獸」為報復人類，開始吞食人類，而人類不敵「巨獸」，只能呼喚「神」與它們戰鬥，一個充斥着劍、英雄及神話時代由此誕生。人類通過獵殺「巨獸」漸漸繁榮起來。以狩獵巨獸維生的吉羅遇見了不知被何者追趕的庫彌為了拯救她，吉羅拋開過去的悲傷，開始了一場解開世界秘密的冒險。