喜歡閃閃發亮物品的女高中生谷川瑠璃，抱著「說不定我也找得到！」的想法，於是走進山裡尋找水晶。在那裡她遇見了主修礦物學的研究生荒砥凪，兩人便開始了一起採集礦物的日常。有時走在山道上尋找水晶，有時泡在河水裡撿石榴石，有時對著陌生礦物透過顯微鏡觀察——在凪的帶領下，瑠璃一頭栽進了礦物採集的世界。「就連我也一定能採到才對！」每個人心中曾懷抱過的夢。動真格的科學冒險，就此展開！

在名為「童守町」的地區，在當地有座校史悠久的小學「童守小學」。某天一名青年鵺野鳴介應聘成為該校五年三班的導師，最初班上的學生們對於其左手總是配戴黑色手套、話不離妖魔鬼怪的奇異舉動感到不以為然，甚至出言揶揄鳴介，但隨著班上同學、校園師生、其他人士陸續遭遇靈異事件，鵺野鳴介義不容辭去為眾人解決事件，班上同學們才知道鳴介其實是擁有強大靈力、貨真價實的除靈者...

這個故事的舞台設在2052年，由諾貝爾獎得主、神經科學家"史金納博士"創造並普及的奇蹟藥物"Hapuna"，可以治療一切疾病的世界。然而，從Hapuna公開的三年後，史金納博士再次現身，宣布該藥物的實際有效期其實非常短，服用者在約三年後將會死亡。面對這個瀕臨的世界危機，為了找到史金納博士並產出疫苗，一個由五人特工組成的"LAZARUS洛"部隊應運而生.....