应该是从遥远的宇宙彼方K隆星来侵略地球的KERORO小队，在剧场版中却将地球从可怕的危机中拯救出来……这一次，KERORO军曹的面前出现了最新！最恶！最强的敌人！！　　故事讲述冬树与KERORO小队一起去印加帝国的马丘比丘足迹参观，喜欢神秘事物的冬树当然是大为高兴，可是KERORO的脑袋里面装满了要侵略地球的事情。他们在那里因为迷路而发现了遗迹，后来因为突发状况而不得不从那里逃出。但在那时，冬树一瞬间看见了一位伫立在迷途中的少女。抱着对少女的不解之迷，冬树与KERORO回到了东京。不过这时，最强的敌人

雷格西渴望未来能和哈鲁在一起，生活在肉食动物和草食动物和平共存的世界。为了这个目标，他继续走在艰难的道路上，反抗邪恶势力，并对抗自己的本能。

那场“御军”在令和时代复活——神月从千叶县搬到了群马县。 搬家时，他联系了住在群马县的好朋友轰，但轰说：“...... 别来，没有人来过群马还活着回来过。”群马是什么样的地方？ 接下来会发生什么？ 那