17年前，美军在非洲战场上俘虏到传说中不死的神兵，从此人类称呼这种跟自己长得一模一样却又不会死亡的生物叫做“亚人”。亚人不会因为任何因素死亡，因此只能通过“死过一次”来分辨。普通的高中生永井圭在放学途中被卡车意外撞死，却又马上复活。于是成为“日本国内第3个亚人”的他，从此被投以高额悬赏。不想成为实验动物的他，便与好朋友海斗，展开了浪迹天涯的旅行。

在这个世界上，存在着能够永生不死的人类，即使遭到致命的重创，也会在短时间内迅速恢复，人们称之为“亚人”。永井圭（宫野真守配音）是一名平凡的高中生，某日，一场车祸让他亚人的身份曝光，随即遭到了有关政府部

​所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了除妖的店“物怪庵”。在那里的是一脸不高兴的店主·安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……。安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。