名闻遐迩的剑客，宫本武藏。17岁前，恶贯乡里，不知生之意义。17岁后，远赴关原之战，死里逃生。又被泽庵和尚捆绑于千年杉上、囚于天守阁中，而后重获生命、茅塞顿开。以艰难当饼、以困苦当水，足迹遍历日本各地。曾与66位高手比武，皆获全胜，尤以打败名剑客佐佐木小次郎的“岩流岛之战”震烁古今！一个苦其心志的修行武者，一位17世纪的剑道家，一名400年前的传奇人物。　　晚年，宫本武藏在熊本市近郊金峰山的灵岩洞中，将自己的一生以及独创的“二天一流”的剑法，记录了下来，那本书就是后来成为了传世名作的《五轮书》。

出擊的EVA暫定五號機、被分發部屬的EVA二號機與其駕駛、消滅的EVA四號機。強制進行的EVA三號機啟動實驗，以及自月球飛來的EVA六號機與其駕駛。逐漸崩潰的碇真嗣的故事，究竟會通往何種結局？

本作品為《天元突破 紅蓮螺巖》電視動畫第15話 ～ 第27話的總集編。